Das Forschungsprojekt RUN ist unterteilt in drei Teilmodule und ein Kernmodul.
In den Teilmodulen I bis III arbeiten die verschiedenen wissenschaftlichen Fachdisziplinen teils eng mit Praxispartner*innen an einem speziellen Thema des Projekts zusammen. Die Projektpartner*innen bearbeiten parallel ingenieurwissenschaftliche und pflanzenbauliche Fragestellungen, entwickeln sozialwissenschaftliche Analysen, erarbeiten aber auch landschaftsökologische und ökonomische Modelle.

​

Das zentrale Kernmodul garantiert, dass sämtliche Teilergebnisse aus den verschiedenen Teilmodulen zusammengeführt werden. Dies geschieht zwar auch bereits innerhalb der Teilmodule. Die verantwortlichen Partner*innen im Kernmodul sorgen jedoch laufend für den umfassenden Wissensaustausch aller Perspektiven der verschiedenen Fachdisziplinen und Praktiker*innen. Somit wird RUN zu einem inter- und transdisziplinären Projekt mit ganzheitlichen Lösungen als Ergebnis.